【噬纪家园】
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知噬分子
2026年7月
13
第
168
期
一周要闻抢先看
【行业进展】欧盟加速布局噬菌体临床研究,三大项目总投入约4570万欧元;WHO召开首届全球噬菌体实践社区会议,推动全球协作网络建设;日本Arrowsmith融资10.5亿日元,推进噬菌体临床开发;EUCAST启动噬菌体药敏国际标准体系建设;EUCAST更新全基因组耐药预测应用建议;EUCAST更新WGS耐药预测应用建议
【科研进展】噬菌体调控AIEC毒力改善克罗恩病结肠炎;生物被膜机械驱动局部解聚机制解析;PALACE突破宏基因组噬菌体组装瓶颈;综述:噬菌体递送策略与临床转化关键瓶颈;肠道菌群"涟漪效应"形成机制与预测框架;噬菌体通过释放维生素B12广泛调控细菌群落;构建即用型T4噬菌体多表位疫苗平台
01 行业进展
欧盟加速布局噬菌体临床研究 三大项目总投入约4570万欧元
近日,欧盟"Horizon Europe"计划持续推进噬菌体治疗抗菌药物耐药(AMR)感染的临床研究布局,目前已资助三项国际临床项目,总金额约4570万欧元。
其中,由德国Universitätsmedizin Frankfurt牵头的REPhRAME项目(1500万欧元)聚焦复发性尿路感染,评估噬菌体联合肠道微生物群恢复策略;由加拿大Unity Health Toronto牵头的P-PEAKS UTI项目(1560万欧元)开展Ⅱ期随机对照临床试验,探索个体化噬菌体联合β-内酰胺类抗生素预防复发性大肠杆菌尿路感染;由加拿大Qeen Biotechnologies牵头的PHAGE4DAIR项目(1490万欧元)开展Ⅰ/Ⅱ期临床试验,评估标准化噬菌体鸡尾酒治疗金黄色葡萄球菌假体关节感染。三项研究分别覆盖个体化噬菌体、标准化噬菌体制剂及噬菌体联合微生物组治疗策略,显示欧盟正系统推进噬菌体治疗临床证据体系建设。
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WHO召开首届全球噬菌体实践社区会议 推动全球协作网络建设
世界卫生组织(WHO)宣布将召开首届全球噬菌体实践社区(Bacteriophage Community of Practice)网络研讨会,推动全球噬菌体领域协作。该社区旨在汇聚噬菌体研究、临床应用、监管和政策等领域参与者,加强针对抗菌药物耐药(AMR)问题的国际交流。会议期间,WHO将介绍全球噬菌体生态系统调查结果,并分享主要区域及国际噬菌体网络进展。近年来,随着多重耐药菌感染威胁不断增加,噬菌体作为一种具有特异性抗菌潜力的治疗策略,正面临临床证据、应用规范和全球协作等方面的挑战。此次WHO推动建立实践社区,有望促进相关领域经验共享和协同发展。
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日本Arrowsmith融资10.5亿日元 推进噬菌体临床开发
近日,日本噬菌体治疗企业Arrowsmith宣布完成10.5亿日元Series A融资,并披露其核心产品ARW001已完成美国食品药品监督管理局(FDA)Pre-IND沟通。值得关注的是,Arrowsmith成立于2025年,其核心技术源自日本大型药企Astellas Pharma Inc.(安斯泰来)与岐阜大学开展的五年联合研究成果,目前由Arrowsmith负责产业化开发。ARW001是一款针对铜绿假单胞菌感染的噬菌体鸡尾酒,公司计划于2026年内提交IND申请,推进首次人体临床试验。该项目标志着日本大型药企早期布局的噬菌体治疗技术正加速向临床转化,为耐药菌感染治疗提供新的研发路径。
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https://kepple.co.jp/articles/rnr5gzp3si
https://www.j-vgi.co.jp/en/news/arrowsmith260622 【噬纪家园】同刊双发!Eco8防御系统机制;加速!韩国开启首例噬菌体临床试验,噬菌体公司Locus进军眼科;烟头竟是耐药菌放大器
EUCAST明确WGS耐药预测的 临床应用边界
近日,欧洲抗菌药物敏感性试验委员会(EUCAST)噬菌体药物敏感性试验(Phage Susceptibility Testing,PST)分委员会发布立场文件,提出建立国际统一的噬菌体药敏参考方法。文章指出,目前全球尚无标准化PST参考方法、统一结果判读标准及临床断点,这已成为制约噬菌体治疗规范化应用和多中心临床研究的重要瓶颈。目前,EUCAST已制定液体培养PST试验方案,并正在5家专业实验室开展试点验证,后续将通过多中心研究不断完善,为建立国际统一的PST参考方法奠定基础。
相关阅读
https://www.clinicalmicrobiologyandinfection.org/article/S1198-743X(26)00317-4/abstract
EUCAST更新WGS耐药预测应用建议
近日,欧洲抗菌药物敏感性试验委员会(EUCAST)发布2025版全基因组测序(WGS)耐药预测更新文件。文件认为,WGS在区分野生型与非野生型菌株方面已取得显著进展,尤其适用于结核分枝杆菌,以及临床断点与流行病学界值(ECOFF)一致的情形;但现有证据仍不足以支持其直接用于临床用药决策。EUCAST提出,后续应使用参考药敏方法获得高质量表型数据,建设具有代表性的基因型-表型数据库,统一物种特异性解释规则和生物信息学输出,并建立外部质量评价体系,同时评估人工智能、检测成本和周转时间,以推动WGS耐药预测规范化应用。
相关阅读
https://www.clinicalmicrobiologyandinfection.org/article/S1198-743X(26)00248-X/fulltext
02 科研进展
No.1 Sci Transl Med
Brian K. Coombes 团队
噬菌体调控AIEC毒力改善克罗恩病结肠炎
近日,来自加拿大麦克马斯特大学(McMaster University)的Brian K. Coombes团队发现,靶向克罗恩病(Crohn's disease, CD)相关黏附侵袭性大肠杆菌(adherent-invasive Escherichia coli, AIEC)的噬菌体HER259,不仅可抑制细菌致病性,还能改善结肠炎并增强皮质类固醇疗效。研究筛选获得对临床AIEC分离株具有活性的HER259,在体外和体内均显著降低AIEC毒力,通过促使fimS启动子翻转至"关闭"状态,抑制FimH黏附素表达,从而削弱细菌黏附和侵袭能力;停止噬菌体治疗后,fimS恢复翻转并重新激活结肠炎。在小鼠结肠炎模型中,HER259显著减轻疾病严重程度,并增强亚治疗剂量布地奈德(budesonide)的疗效,该作用不依赖于微生物药物代谢。研究表明,噬菌体不仅能够靶向编辑致病菌,还可通过调控细菌毒力提高宿主对常规治疗的响应,为炎症性肠病(IBD)辅助治疗及减少激素相关不良反应提供了新的策略。

doi: 10.1126/scitranslmed.adz4589
No.2 Nat Microbiol
Gürol M. Süel 团队
生物被膜机械驱动局部解聚机制解析
近日,来自加州大学圣迭戈分校(UCSD)的Gürol M. Süel团队发现,细菌生物被膜解聚并非仅依赖胞外基质(extracellular matrix, ECM)降解,还存在一种由机械力驱动的全新局部解聚机制。研究利用近单细胞分辨率活细胞成像、数学建模以及遗传学和化学干预发现,枯草芽孢杆菌在短暂营养饥饿后,会产生胞外聚γ-谷氨酸(poly-γ-glutamic acid, γ-PGA)水凝胶。该水凝胶吸水膨胀后产生渗透压,将生物被膜内部的运动型细胞沿局部通道推出,实现局部而非整体解聚,而这一过程不依赖ECM降解。进一步实验表明,敲除γ-PGA合成基因capBCAE后,局部解聚完全消失;加入500 mM山梨醇抑制γ-PGA吸水膨胀,同样可阻断细胞释放;相反,过表达γ-PGA可在无营养饥饿、无药物处理条件下直接诱导生物被膜整体破裂并脱落。该研究提出了区别于经典ECM降解的新型生物被膜解聚模型,为调控慢性感染相关生物被膜及开发新的抗生物被膜策略提供了新的研究思路。

doi: 10.1038/s41564-026-02413-4
No.3 Nat Biotechnol
李帅成/汪建平 团队
"PALACE"突破宏基因组噬菌体组装瓶颈
近日,来自香港城市大学的李帅成/汪建平团队开发出宏基因组噬菌体基因组组装新方法PALACE,突破传统方法依赖单个contig进行噬菌体识别和组装的局限,实现复杂宏基因组中高质量噬菌体基因组重建。PALACE融合参考序列比对、噬菌体蛋白识别、深度学习及共轭图算法,可将碎片化序列重新组装为完整基因组。在124份人类肠道宏基因组样本中,PALACE组装得到的噬菌体基因组完整度中位数达到98.19%,显著高于第二优方法的42.21%;获得的709个噬菌体基因组中,64.32%达到完整或高质量水平。进一步分析914份人类肠道宏基因组样本,共获得5306个高质量噬菌体基因组,并发现结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者来源噬菌体中代谢相关基因显著富集,提示噬菌体可能通过代谢适应参与疾病相关肠道微生态变化。该方法为噬菌体功能解析、宿主预测及疾病关联研究提供了重要技术支撑。

DOI:10.1038/s41587-026-03188-z
No.4 Cell Host Microbe
Paul L. Bollyky/Krystyna Dabrowska 团队
综述:噬菌体递送策略与临床转化关键瓶颈
近日,来自斯坦福大学和波兰科学院Hirszfeld免疫学与实验治疗研究所的Paul L. Bollyky/Krystyna Dabrowska团队发表综述,系统分析了影响噬菌体治疗临床疗效的关键因素,并指出,随着噬菌体治疗逐步进入临床,限制其疗效的核心问题已由“能否筛选到有效噬菌体”转向“能否将噬菌体有效递送(delivery)至感染部位”。文章结合2005—2025年323例个体化噬菌体治疗病例及临床研究进展,总结了不同感染部位对静脉、口服、吸入和局部给药等递送方式的要求,并重点分析了解剖屏障、生物被膜、宿主免疫以及药代动力学/药效学(PK/PD)等因素对噬菌体体内分布、稳定性及治疗效果的影响。同时,作者归纳了脂质体、水凝胶、微胶囊、纳米材料及工程化噬菌体等新型递送策略在提高噬菌体稳定性、延长体内停留时间和增强感染灶富集方面的研究进展,并提出建立标准化药敏检测、优化递送方式及给药方案,将是推动噬菌体治疗规范化应用和临床转化的重要方向。

doi: 10.1016/j.chom.2026.06.013
No.5 Cell Host Microbe
戴磊 团队
肠道菌群"涟漪效应"形成机制与预测框架
近日,中国科学院深圳先进技术研究院定量合成生物学全国重点实验室/合成生物学研究所戴磊研究员团队受邀在Cell Host & Microbe受邀发表观点文章,提出肠道菌群"涟漪效应"(ripple effects)理论框架,系统阐述靶向干预如何通过微生物生态网络引发群落结构和功能的级联变化。文章指出,在高度互联的肠道微生态系统中,噬菌体治疗、噬菌体裂解酶、窄谱抗生素等精准干预虽然仅作用于特定菌种,但其影响可沿种间互作网络传播,重塑群落组成、代谢功能、病原体定植抵抗及宿主免疫等关键功能。作者进一步从代谢互养、生态位重塑、宿主介导互作及关键物种(keystone species)等层面解析"涟漪效应"的形成机制,并提出融合合成菌群、噬菌体精准扰动、生态网络理论及人工智能(AI)预测模型的研究范式,为肠道微生物组精准预测、调控及工程化设计提供新的理论框架。

doi:10.1016/j.chom.2026.06.002
No.6 ISME J
Bryan B. Hsu 团队
噬菌体通过释放维生素B12广泛调控细菌群落
近日,来自Virginia Tech的Bryan B. Hsu团队发现,噬菌体裂解宿主细胞后可释放具有重要代谢价值的维生素B12(cobalamin),并通过营养物质共享广泛调控非宿主细菌群落。研究构建维生素B12产生菌与依赖菌模型证实,噬菌体裂解释放的B12足以支持依赖菌及多种人肠道共生菌生长,而完整细菌培养上清则无法提供足够B12。进一步在模拟肠道菌群中发现,噬菌体裂解B12产生菌后,依赖B12菌群显著富集,群落Shannon多样性指数提高3.73倍;补充外源B12或蛋氨酸后,这一效应明显减弱。研究揭示,噬菌体不仅通过裂解宿主发挥作用,还可通过释放关键代谢物改变整个微生物群落组成,为理解噬菌体调控肠道微生态及噬菌体治疗的间接生态效应提供了新的机制。

doi: 10.1093/ismejo/wrag160
No.7 Antiviral Res
杨航 团队
构建即用型T4噬菌体多表位疫苗平台
近日,来自中国科学院武汉病毒研究所的杨航团队开发出一种基于T4噬菌体的即用型(ready-to-use)多表位疫苗平台,并以新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)完成概念验证。研究首先筛选获得NDV高度保守中和表位HN2,结合人工智能(AI)辅助抗原设计和CRISPR-Cas12a基因编辑,将3×HN2序列稳定整合至T4噬菌体基因组,实现抗原随噬菌体复制同步表达和衣壳展示,无需体外偶联即可直接获得工程化疫苗3HN2-T4。动物攻毒试验显示,点眼鼻滴免疫可实现100%保护,显著降低病毒复制、排毒及组织病理损伤,其中口咽和泄殖腔病毒排毒均低于商品化LaSota活疫苗。研究建立了"表位筛选—载体适配—体内整合"的通用开发流程,为新发传染病多表位疫苗的快速设计与部署提供了可扩展的平台技术。

doi: 10.1016/j.antiviral.2026.106449.
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