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知噬分子
2026年8月
31
第
175
期
一周要闻抢先看
【行业进展】重要进展:韩国首个噬菌体药物临床试验通过首轮安全评估;美国政府3690万美元采购耐药菌抗生素头孢地尔
【科研进展】前噬菌体激活可在生物膜中“制造”功能DNA;噬菌体感染宿主的空间策略:自身三维结构重组并选择宿主区域;定向进化训练噬菌体,扩大糖尿病足金葡菌宿主范围;代谢与生态双重限制或解释古菌为何不致病;个性化噬菌体治疗联合黏菌素清除假体关节菌耐药感染
01 行业进展
重要进展:首个韩国噬菌体药物 完成人体试验首轮安全性验证
近日,韩国MicrobiotiX宣布,其噬菌体药物MP101治疗急性铜绿假单胞菌肺炎的首次人体I期临床试验已完成哨兵队列(sentinel cohort)。受试者完成72小时安全性和耐受性评估后,未发现阻碍试验继续的安全问题,后续入组已启动。该随机、双盲、安慰剂对照研究计划纳入18名成人患者,在标准抗生素治疗基础上单次静脉给予MP101或安慰剂。MP101是韩国首个获食品医药品安全处(MFDS)批准进入临床的噬菌体治疗药物,主要针对常与多重耐药相关的铜绿假单胞菌感染。
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3690万美元! 美国政府采购头孢地尔应对耐药菌
近日,日本SHIONOGI(盐野义制药)宣布,美国政府通过生物医学高级研究与开发局(BARDA)的Project BioShield行使首个采购选择权,以3690万美元采购抗生素头孢地尔(cefiderocol,商品名Fetroja),用于加强对难治性革兰阴性菌感染及高优先级生物威胁的应对能力。双方相关合同初始资金为1.19亿美元,若后续选择权全部推进,总金额最高可达4.82亿美元;合同还涉及美国本土生产基地建设、高优先级病原体感染适应证开发以及儿童院内肺炎等适应证拓展。
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.https://www.shionogi.com/jp/ja/news/2026/08/20260828.
02 科研进展
No.1 Angew. Chem. Int. Ed.
Gabriel Antonio S. Minero 团队
前噬菌体激活可在生物膜中“制造”功能DNA
近日,来自奥胡斯大学的Gabriel Antonio S. Minero团队发现,前噬菌体不仅可通过裂解细菌释放DNA,其复制机制还可能被利用,在生物膜中进一步合成具有特定结构和功能的胞外DNA(eDNA)。eDNA是生物膜基质的重要组成部分,但噬菌体如何影响其形成及功能仍不清楚。研究人员在希瓦氏菌和枯草芽孢杆菌中加入人工设计的环状DNA模板;营养限制激活前噬菌体并导致细胞裂解后,噬菌体复制相关组分利用滚环复制(RCR),按照外源模板生成大量G-四链体(GQ)DNA。实时监测显示,新DNA主要在细菌裂解后产生,并与前噬菌体复制过程同步。
更值得关注的是,研究展示了将前噬菌体复制机制用于原位制造功能DNA材料的可能性。新生GQ-DNA在希瓦氏菌中形成≤10 μm的球状结构,在枯草芽孢杆菌中形成>50 μm的线状结构;加入模板后,希瓦氏菌生物膜最大电流密度由约1.8增至5.3 nA/cm²,共培养生物膜中的GQ-DNA结构还表现出过氧化物酶活性。该研究由此将前噬菌体从生物膜eDNA形成的参与者进一步拓展为可利用的DNA合成工具,为在活细菌群落中按设计模板构建功能DNA材料提供了新方向。

doi:10.1002/anie.3695434
No.2 Sci. Adv.
Martial Marbouty 团队
噬菌体感染宿主的空间策略:自身三维结构重组并选择宿主区域
近日,来自巴斯德研究所的Martial Marbouty团队解析了烈性噬菌体PAK_P3感染铜绿假单胞菌时,病毒与宿主基因组的三维动态。以往研究多关注噬菌体感染中的基因表达和生化过程,但噬菌体DNA进入细胞后如何组织自身、又如何在空间上与宿主染色体互作仍不清楚。研究人员利用可分析DNA空间接触关系的高通量染色体构象捕获技术(Hi-C),结合转录组学追踪其约20 min感染周期。研究发现,PAK_P3基因组进入细胞后迅速由高度压缩状态展开;感染3 min时,约14 kb的早期表达基因区域形成独立的松散环状结构,随后形成与不同阶段基因表达相对应的结构域,至16 min又重新压缩并装入新生噬菌体。与此同时,宿主染色体逐渐去压缩、局部转录相关结构消失。更值得关注的是,PAK_P3并非随机接触宿主染色体,而是更倾向于转录活性较低的区域。研究揭示,噬菌体感染不仅涉及对宿主资源的生化劫持,还伴随着病毒自身基因组的有序重组以及与宿主染色体的选择性空间互作,为理解噬菌体如何快速完成感染周期提供了新的三维视角。

doi:10.1126/sciadv.aef2512
No.3 Antimicrob Agents Chemother
Lucile Plumet 等
定向进化训练噬菌体,扩大糖尿病足金葡菌宿主范围
近日,来自法国蒙彼利埃大学、尼姆大学医院等机构的Lucile Plumet等针对糖尿病足感染中噬菌体宿主范围狭窄的问题,对金黄色葡萄球菌噬菌体SAVM02进行“噬菌体训练”(phage training)。研究将其在4株敏感和4株不敏感的临床金葡菌中连续传代20轮,通过定向进化获得SAVM02-P20。
在31株糖尿病足相关金葡菌临床分离株中,原始SAVM02仅能感染12株(38.7%),训练后的SAVM02-P20可感染24株(77.4%),宿主范围扩大约39个百分点,且未丢失对原有敏感菌株的活性。机制实验发现,这种提升并非源于吸附能力增强,而主要与噬菌体在原本不敏感菌株中的复制效率提高有关:在C1BP006Pied菌株中,SAVM02-P20在1–2h内可增殖至10^8–10^9PFU/mL,而原始噬菌体4h后仅约10^7PFU/mL。
不过,体外宿主谱扩大并未完全转化为体内疗效。斑马鱼胚胎模型中,SAVM02-P20对原本高度敏感菌株可将感染后的约10%存活率提高至接近100%,但对经训练后在体外获得敏感性的C1BP006Pied,存活率仍约10%。研究表明,定向进化可显著拓宽治疗性噬菌体的宿主范围,但体外“训练成功”并不意味着体内治疗同样有效,为建立预先训练的噬菌体库及个体化噬菌体治疗提供了依据,也提示后续仍需结合更接近临床环境的模型进行筛选。

doi:10.1128/aac.00639-26
No.4 mBio
Daniel J. Harrison 团队
代谢与生态双重限制或解释古菌为何不致病
近日,来自奥克兰大学的Daniel J. Harrison等围绕“为何迄今尚未发现可靠确认的致病古菌”这一长期未解问题,对数千种细菌和古菌进行了比较分析。研究发现,在纳入分析的细菌中,所有致病种均具备化能有机异养(COH),即能以有机物同时获取能量、电子和碳,系统发育模型进一步支持COH可能是致病性演化的代谢前提。
然而,古菌并非普遍缺乏COH:研究分析806种分离古菌发现,约68%具备COH能力,但其中约79%生活于高温、高盐等极端环境;相比之下,生活于多细胞真核宿主的古菌主要不具备COH。 作者据此提出,古菌缺少已知病原体可能源于“代谢能力+生态机会”的双重限制:具备COH的古菌通常缺少接触宿主的机会,而宿主相关古菌又缺少潜在致病所需的代谢能力。该研究为长期以来“为何没有古菌病原体”的问题提出了可检验的代谢-生态学假说,但结论目前主要基于已分离培养古菌,尚需在未培养古菌中验证。

doi: 10.1128/mbio.01185-26
No.5 Int J Infect Dis
Lucas Mora-Quilis 等
个性化噬菌体治疗联合多黏菌素清除假体关节菌耐药感染
近日,西班牙萨拉戈萨国防总医院和瓦伦西亚大学等机构报道了一项个体化噬菌体治疗多重耐药肺炎克雷伯菌假体肘关节感染的案例。患者因战争中的爆炸严重受伤,接受全肘关节置换后发生感染;病原菌携带ESBL、OXA-48和NDM等耐药决定因素,经多种抗生素长期治疗及反复清创仍复发,一度面临截肢。
团队对患者先后分离的6株肺炎克雷伯菌进行检测,发现均为K2荚膜型,并筛得对全部分离株具有裂解活性的个体化噬菌体。随后在保留假体清创基础上,采用噬菌体联合黏菌素治疗。噬菌体单次剂量为1.25×10^8 PFU,前5天每日局部给药1次、静脉给药2次,之后继续静脉给药。细菌负荷数日内下降3.52 log,第8天已检测不到肺炎克雷伯菌,第12、15天仍为阴性。噬菌体原计划治疗15天,因临床改善明显且耐受良好,经批准延长至56天以巩固疗效;最终伤口愈合,肘关节活动部分恢复。
值得关注的是,血浆噬菌体中和实验显示,第14天活性噬菌体滴度下降1.64 log,第50天降幅>4 log,而细菌快速清除主要发生在治疗第一周。作者认为,这一时间关系支持早期强化噬菌体治疗,以争取在宿主免疫反应可能削弱噬菌体活性前降低细菌负荷。治疗结束后30天内未见感染复发,但作者提到,之后因患者被本国政府接回而无法继续随访。

doi: 10.1016/j.ijid.2026.109079
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