【噬纪家园】
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知噬分子
2026年9月
7
第
176
期
一周要闻抢先看
【行业进展】BiomX正式转向国防安全,PHGE代码将退出历史;IDSA更新耐药革兰阴性菌治疗指导,多款新药进入推荐;WHO发布20项建议,将公平性纳入全球耐药治理;耐药鲍曼肺炎新药获FDA快速通道,推进III期
【科研进展】DRT2双重感知噬菌体入侵并触发细菌自杀防御;尿路微环境与尿流削弱抗生素和噬菌体疗效;尿路微环境与尿流削弱抗生素和噬菌体疗效;噬菌体RNA聚合酶低温高效合成mRNA,dsRNA杂质降低约100倍;英国首例噬菌体联合DAIR治疗慢性金葡菌假体关节感染;水凝胶递送噬菌体:19项体内研究验证局部抗感染潜力;噬菌体水凝胶清除瘤内细菌增强溶瘤免疫治疗;噬菌体优先给药诱导耐药菌对β-内酰胺交互敏感;爱德华氏菌宿主适配重组工程系统的开发;肺炎链球菌磷霉素外排泵FoeAB及其耐药机制
01 行业进展
BiomX正式转向国防安全, PHGE代码将退出历史
9月1日,曾布局噬菌体疗法的BiomX Inc.宣布,将于9月11日正式更名为Tessera Defense and Homeland Security Inc.,纽约证券交易所美国市场股票代码由“PHGE”变更为“HLSQ”。公司表示,此次更名标志其向国防及国土安全技术集团的转型完成。目前业务组合已转向威胁探测、人工智能分析等国防及关键基础设施相关技术。此次更名也成为BiomX业务重心从生物医药领域转向国防安全技术的重要节点。
相关阅读
https://www.sec.gov/Archives/edgar/data/1739174/000121390026096273/ea030420901ex99-1.htm
IDSA更新耐药革兰阴性菌治疗指导 多款新药进入推荐
7月30日,美国感染病学会(IDSA)发布2026版耐药革兰阴性菌治疗指导,替代2024版指导。新版覆盖耐碳青霉烯肠杆菌目细菌、耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌、难治性耐药铜绿假单胞菌等重要耐药菌,并根据最新证据调整治疗策略。其中,氨曲南-阿维巴坦被纳入NDM型耐药菌优选方案;针对侵袭性嗜麦芽窄食单胞菌感染,头孢地尔单药升为优选治疗。新版还纳入多种近年来获批的新型抗菌药,为耐药菌感染治疗提供更多选择。
相关阅读
https://www.idsociety.org/practice-guideline/amr-guidance/
WHO发布20项建议, 将公平性纳入全球耐药治理
9月2日,世界卫生组织(WHO)发布抗微生物药物耐药性(AMR)新指导文件,提出将公平性进一步纳入各国AMR国家行动计划。文件围绕水、环境卫生与个人卫生,医疗服务和基本抗生素可及性,以及耐药性和抗微生物药物使用监测与响应三大场景,提出20项建议,覆盖WHO以人为本方法中的13项核心干预措施。WHO指出,各国应结合自身情况逐步加强兼顾公平性的耐药防控行动。
相关阅读
https://www.who.int/publications/i/item/9789240123892
耐药鲍曼肺炎新药 获FDA快速通道,推进III期
9月2日,瑞士BioVersys AG宣布,美国食品药品监督管理局(FDA)授予抗菌药BV100快速通道资格,用于治疗碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌复合群导致的医院获得性及呼吸机相关细菌性肺炎。BV100是一种静脉用利福布汀新制剂,目前正开展全球关键III期临床试验。此前II期研究显示,与最佳可用治疗相比,BV100组总体死亡率降低50%。快速通道资格将支持企业与FDA更频繁沟通,并使其具备滚动审评资格。
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02 科研进展
No.1 Cell Host Microbe
贾宁 团队
DRT2双重感知噬菌体入侵并触发细菌自杀防御
近日,来自南方科技大学的贾宁团队揭示了细菌抗噬菌体系统DRT2如何识别噬菌体入侵并启动“自杀式”防御。DRT2此前已知可通过滚环逆转录生成有毒Neo蛋白、阻断噬菌体扩增,但它究竟如何感知感染、Neo又如何杀死宿主细胞一直不清楚。 研究发现,DRT2具有两条相互协同的“警报通路”:一方面可感知噬菌体编码的单链DNA结合蛋白SSB/SSAP;另一方面,噬菌体NrdAB会升高宿主细胞内dGTP水平,从而激活DRT2。激活后的DRT2以非编码RNA(ncRNA)为模板进行滚环逆转录,大量生成重复的双链ccDNA,并进一步表达无终止密码子的neo基因。SSB、SSAP或NrdAB单独表达即可使ccDNA产量提高200-2000倍。 最终产生的Neo蛋白直接定位细菌膜并引起膜去极化和生长停滞/细胞死亡,以牺牲被感染细胞为代价限制噬菌体传播。 更值得关注的是,团队还证明DRT2的ncRNA模板可以重新编程,使其在无需噬菌体感染的情况下合成用户指定的高丰度双链DNA,为开发可编程胞内DNA合成工具提供了新的可能。

doi:10.1016/j.chom.2026.08.006
No.2 Nat Commun
Ramon Garcia Maset 等
尿路微环境与尿流削弱抗生素和噬菌体疗效
近日,来自牛津大学和伦敦大学学院的研究团队发现,尿液、尿路上皮及尿流等真实尿路微环境可改变尿路致病性大肠杆菌(UPEC)的感染状态,并削弱抗生素和噬菌体的治疗效果。研究显示,与标准培养基相比,尿液中呋喃妥因和噬菌体鸡尾酒LCPR1的杀菌效果均下降;进一步加入人尿路上皮后,即使采用临床相关浓度的呋喃妥因,仍无法完全清除细菌,细胞内细菌群落(IBC)持续存在。静态3D模型中,LCPR1联合呋喃妥因可完全清除浮游菌,并使微组织相关菌量降低约4log CFU。加入模拟膀胱充盈和排尿的尿流后,UPEC的上皮黏附和胞内侵袭增加,20h时上皮覆盖率由约10%升至22%;同时,静态条件下可完全清除的浮游菌在联合治疗后仅降低约4log。 研究提示,感染部位的微环境和流体动力学是影响抗感染疗效的重要因素,更接近人体生理条件的模型有助于更准确评价抗生素和噬菌体疗效。

doi:10.1038/s41467-026-76589-y
No.3 PNAS
Lucile Plumet 等
噬菌体RNA聚合酶低温高效合成mRNA,dsRNA杂质降低约100倍
近日,来自New England Biolabs(NEB)的Dillon B. Nye等发现,铜绿假单胞菌噬菌体Njord编码的天然RNA聚合酶(Njord RNAP),可在较低温度下高效合成mRNA,同时大幅减少具有免疫刺激性的双链RNA(dsRNA)杂质。目前mRNA生产广泛使用T7 RNA聚合酶,但转录过程中产生的dsRNA杂质可激活先天免疫,增加后续纯化需求。研究显示,Njord RNAP的最适转录温度比T7 RNAP低10–15°C;在12°C下T7 RNAP几乎失活,而Njord RNAP仍可产生超过1mg/mL RNA。更重要的是,在多种mRNA及不同核苷酸修饰条件下,Njord RNAP产生的dsRNA约比T7 RNAP低100倍,且未牺牲RNA产量。 细胞和小鼠实验进一步显示,这类mRNA引起的免疫反应显著降低。研究表明,Njord RNAP兼具低温高效转录和低dsRNA杂质两项特点,为提高治疗性mRNA的生产质量、简化制造流程提供了新的噬菌体来源工具。

doi:10.1073/pnas.2606667123
No.4 ASM Case Reports
A. Scobie 团队
英国首例噬菌体联合DAIR治疗慢性金葡菌假体关节感染
近日,来自英国皇家自由伦敦医院、皇家国家骨科医院及伦敦大学学院的Antonia Scobie团队,报告了英国首例关节腔内噬菌体联合清创、抗生素及植入物保留术(DAIR),治疗慢性金黄色葡萄球菌假体关节感染(PJI)的病例。患者为81岁男性,膝关节假体感染甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)后,历经多次手术和长期抗生素治疗仍反复形成窦道,且因合并症不适合大型翻修手术并拒绝截肢,因而接受挽救性噬菌体治疗。 团队针对患者菌株筛得ISP和Phage 25两株裂解性噬菌体,并发现ISP与多种抗生素具有协同作用。但从筛选到实际治疗期间,监管审批及物流流程耗时较长,Phage 25制剂在治疗获批前已超过有效期,最终只能使用ISP单噬菌体治疗;作者指出,治疗延迟还可能使感染进展、生物膜进一步成熟,降低感染根除的可能性。 患者接受DAIR及抗生素治疗,并于术后第1、8、15天接受3次关节腔内ISP给药。治疗后2周内窦道全部关闭,但第4周部分复发;18个月随访时症状和活动能力仍较治疗前改善,仅剩1条持续窦道,并避免了进一步住院、静脉抗生素治疗及截肢,但感染并未根除。该病例既验证了噬菌体联合DAIR在英国临床实施的可行性与安全性,也凸显了监管延迟、单噬菌体治疗及局部给药暴露等可能限制疗效的现实问题。

doi: 10.1128/asmcr.00082-26
No.5 Biomaterials
陈刚 团队
噬菌体水凝胶清除瘤内细菌增强溶瘤免疫治疗
近日,来自青岛市中心医院的Gang Chen团队构建了一种杂合噬菌体水凝胶,通过清除肿瘤内细菌增强乳腺癌溶瘤免疫治疗。研究将可靶向并裂解肿瘤细胞的工程化M13噬菌体,与靶向大肠杆菌的YZ2噬菌体共同组装成水凝胶,使其在酸性肿瘤微环境中持续释放:前者杀伤肿瘤细胞,后者清除可促进免疫抑制的瘤内大肠杆菌。 在三阴性乳腺癌小鼠模型中,清除瘤内细菌后,树突状细胞和CD8+ T细胞活化增强,M2型巨噬细胞、调节性T细胞等免疫抑制细胞减少。 在术后复发转移模型中,该疗法使残余肿瘤体积降至对照组约1/13.5,瘤内细菌由5.67降至2.1 log10 CFU,肺转移负荷降低95%,且未观察到明显器官损伤或肠道菌群紊乱。 研究表明,靶向清除瘤内细菌可能成为解除肿瘤免疫抑制、增强溶瘤免疫治疗的新策略。

doi:10.1016/j.biomaterials.2026.124598
No.6 J Control Release
Markus Rupp 团队
水凝胶递送噬菌体:19项体内研究验证局部抗感染潜力
近日,来自德国吉森大学的Markus Rupp团队系统评估了水凝胶局部递送噬菌体治疗感染的体内证据。研究纳入19项研究,包括3项临床研究和16项临床前研究,后者共涉及28株噬菌体和6种细菌。 水凝胶可保护噬菌体、延长其在感染部位的停留并实现局部释放。结果显示,烧伤和皮肤软组织感染中的疗效最为一致,可降低细菌负荷并改善创面愈合,其中2项烧伤研究还观察到生存改善;但在骨与关节等深部感染模型中,细菌负荷仅降低约0.5-1.5 log10 CFU,仍难以完全清除感染。 研究表明,水凝胶是具有潜力的噬菌体局部递送平台,但临床证据仍有限,给药剂量、释放方式及材料设计仍需进一步标准化和临床验证。

doi: 10.1016/j.jconrel.2026.115335
No.7 Toxicol Rep
Naheeda Portocarero 团队
8株噬菌体饲料制剂完成遗传毒性及90天口服安全评价
近日,来自英国Feed, Food & Future的Naheeda Portocarero团队针对噬菌体用于动物饲料可能带来的安全性问题,对一种靶向沙门菌、大肠杆菌和产气荚膜梭菌的噬菌体混合制剂开展系统毒理学评价。研究按照经济合作与发展组织(OECD)相关指南及良好实验室规范(GLP),分别开展体外基因突变、微核、动物骨髓染色体畸变及90天重复口服毒性试验。结果显示,最高2000μg/mL下未增加基因突变或微核形成,最高80mg/kg体重下未诱导染色体结构异常。 90天大鼠口服试验确定的无观察到不良反应剂量(NOAEL)为200mg/kg体重/天,对应指示噬菌体2.0×10⁹PFU/kg体重/天,约为预期最高暴露水平的100倍。研究为评估该噬菌体制剂用于动物饲料的安全性提供了毒理学依据。

doi:10.1016/j.toxrep.2026.102332
No.8 Antimicrob Agents Chemother
Nicholas M. Smith 团队
噬菌体优先给药诱导耐药菌对β-内酰胺交互敏感
近日,来自美国布法罗大学的Nicholas M. Smith团队发现,噬菌体与抗生素的给药顺序可显著影响联合杀菌效果。研究针对KPC-5型广泛耐药铜绿假单胞菌AR-0231,先使用靶向脂多糖(LPS)的噬菌体PYO2,再给予抗生素,与“抗生素优先”相比,24h菌量降低6.19 log10 CFU/mL。 机制研究显示,PYO2筛选出的耐噬菌体亚群反而产生交互敏感性(collateral sensitivity):6种主要抗铜绿假单胞菌β-内酰胺类的外膜通透性均提高超过25%,其中哌拉西林提高87%。测序发现wzz和migA等LPS相关基因发生突变,提示噬菌体耐药引起的LPS改变可能削弱外膜屏障,使β-内酰胺类更易进入细菌。 研究为“先噬菌体、后抗生素”序贯治疗广泛耐药菌提供了机制依据。

doi: 10.1128/aac.00048-26
No.9 Synth Syst Biotechnol
李瑞娟 团队
爱德华氏菌宿主适配重组工程系统的开发
近日,来自山东大学的李瑞娟团队针对现有λ-Red系统在爱德华氏菌中重组效率低、遗传操作困难的问题,开发了新的宿主适配重组工程(recombineering)系统。团队从爱德华氏菌及其相关噬菌体基因组中挖掘候选重组酶元件,筛选出6套系统,其中BAS_MS17表现最佳。 通过延长同源臂并引入Redg或Plug,研究进一步提升编辑效率,在鱼源分离株中最高提高8倍,同时保持较高准确率。 利用优化系统,团队实现多个靶基因敲除,并鉴定出aroA、fur和hfq等关键毒力相关基因,其中aroA缺失株在小鼠实验中死亡率由100%降至0%。 该系统解决了爱德华氏菌缺乏高效、宿主适配遗传操作工具的难题,为致病机制研究及减毒活疫苗候选株开发提供了新工具。

doi: 10.1016/j.synbio.2026.07.001
No.10 PNAS
Atsushi Taguchi 等
首个肺炎链球菌磷霉素外排泵FoeAB及其耐药机制
近日,来自大阪大学等机构的Atsushi Taguchi等发现了一种此前未知的肺炎链球菌ABC外排泵FoeAB,可将磷霉素主动排出细胞,从而降低细菌对磷霉素的敏感性。研究人员筛选30种候选外排泵,发现过表达FoeAB可使细菌产生磷霉素耐药,并通过脂质体实验直接证实FoeAB能够转运磷霉素。 进一步通过冷冻电镜(cryo-EM)解析FoeAB不同运输状态的结构,发现K22、R132和R253形成的正电荷口袋对识别和运输磷霉素至关重要,破坏这些位点后,FoeAB无法赋予细菌磷霉素耐药。 这是首次发现磷霉素可作为细菌外排泵的底物,为理解革兰阳性菌如何通过药物外排产生抗生素耐药提供了新机制。

doi:10.1073/pnas.2535933123
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