【噬纪家园】重磅政策落地：十部门联合印发医药工业发展“十五五”规划；同一群体中细菌生长速率为何不同？工程菌携前噬菌体预防肠道感染

【噬纪家园】

知噬分子

2026年9月

第

178

期

一周要闻抢先看

【行业进展】医药工业十五五规划重磅落地，抗感染药物迎来发展新机遇；FDA启动新药临床试验加速试点，缩短研发周期；Armata噬菌体药物获FDA突破性疗法认定；个体化噬菌体治疗共识指南发布，明确临床应用全流程

【科研进展】发现90类细菌防御蛋白及其噬菌体识别机制；工程菌携带前噬菌体实现肠道感染长期预防；从群体到单细胞：细菌生长速率的调控机制；生物膜空间结构限制温和噬菌体传播；大肠杆菌通过改变外膜逃避捕食性细菌；温和噬菌体及其卫星推动细菌防御系统快速更新；噬菌体通过NAD+重建反制细菌抗病毒防御；环状三腺苷酸调控细菌抗噬菌体防御系统

01 行业进展

医药工业十五五规划重磅落地，抗感染药物迎来发展新机遇

近日，工业和信息化部等十部门联合印发《医药工业发展“十五五”规划》，提出到2030年，生物医药研发应用稳居世界前列，并从创新发展、产业安全、精准诊疗等8个方面部署25项重点任务。在抗感染领域，《规划》提出加强重大传染病创新药研发，强化新发突发传染病治疗药物的技术储备；重点开发多病原体联合检测和耐药基因快速检测产品，提升传染病早期发现与快速响应能力。同时，《规划》支持抗感染药物纳入世界卫生组织预认证和全球采购体系，并提出优化审评审批机制，加快临床急需创新药械的应用。

相关阅读

工信部等十部门印发《医药工业发展“十五五”规划》

FDA启动新药临床试验加速试点，缩短研发周期

近日，美国食品药品监督管理局（FDA）宣布启动加速新药临床试验申请试点，旨在缩短候选药物从研发到首次人体试验的时间。该试点通过推动药企与具备专业能力的研究机构合作，提高临床试验申请效率，并在保障受试者安全的前提下加快早期临床研发。FDA计划首批遴选8至10组药企与研究机构参与试点，申请截止日期为2026年10月30日。该计划面向新药研发，并非专门针对抗生素或噬菌体药物。

Armata噬菌体药物获FDA突破性疗法认定

近日，Armata Pharmaceuticals宣布，其静脉注射噬菌体药物AP-SA02获美国食品药品监督管理局（FDA）突破性疗法认定，用于辅助治疗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌等引起的复杂性菌血症。Ⅰb/Ⅱa期临床试验显示，抗生素治疗结束28天后，噬菌体联合治疗组100%的患者维持临床应答且未复发，对照组为75%。该认定有望加快药物研发及审评进程，公司计划于2026年下半年启动Ⅲ期临床试验。

个体化噬菌体治疗共识指南发布

近日，来自德国法兰克福大学医院的Silvia Würstle团队牵头制定个体化噬菌体治疗共识指南。该指南汇集20个专业学会、患者代表、监管机构及18名国际专家的意见，提出60余项建议，覆盖患者选择、噬菌体筛选、制剂制备、质量控制及临床应用。指南指出，标准治疗失败、无法实施或存在禁忌时，可逐例考虑噬菌体治疗。治疗前应尽可能培养鉴定致病菌，确认其对所选噬菌体的敏感性；制剂须符合相应质量标准，治疗期间应持续监测并记录疗效及不良事件。指南为个体化噬菌体治疗提供了可操作的实施框架，但其临床疗效仍需更多高质量试验验证。

02 科研进展

No.1 Nature

高晓飞团队

大规模基因组分析发现90类细菌防御蛋白及其噬菌体识别机制

近日，来自斯坦福大学的高晓飞（Alex Gao）团队系统揭示了细菌识别噬菌体的多样化免疫机制。研究通过大规模基因组分析，鉴定出至少90类具有不同识别结构的抗噬菌体防御蛋白。进一步利用包含687个噬菌体基因的文库进行筛选，发现其中13类防御蛋白可分别识别13种保守的噬菌体蛋白，涵盖其主要结构及复制组分。针对防御蛋白Avs7，研究人员通过冷冻电镜揭示，其识别噬菌体主要衣壳蛋白后，可利用细菌自身的蛋白质辅助组装防御复合物，激活DNA切割活性，阻止噬菌体复制。研究表明，细菌能够通过识别噬菌体蛋白的保守结构抵御感染，为理解噬菌体与宿主的相互作用提供了新的分子依据

doi:10.1038/s41586-026-10852-6

No.2 Nat Microbiol

Bryan B. Hsu 团队

工程菌携带前噬菌体实现肠道感染长期预防

近日，来自美国弗吉尼亚理工大学的Bryan B. Hsu团队开发了一种基于前噬菌体的肠道感染预防策略。传统噬菌体治疗面临游离噬菌体难以在肠道内长期维持有效浓度、病原菌定植后难以清除等挑战。研究人员将温和噬菌体P22作为前噬菌体整合至非致病性大肠杆菌基因组中，通过失活前噬菌体自身的c2阻遏蛋白基因，并在大肠杆菌染色体中额外引入正常的c2基因，使工程菌能够稳定携带前噬菌体并持续释放子代噬菌体。由于子代噬菌体携带的c2基因已失活，感染沙门菌后无法产生维持溶原状态所需的阻遏蛋白，因此只能进入裂解周期，杀灭宿主菌。体外实验显示，该工程菌在8小时内几乎完全清除鼠伤寒沙门菌。小鼠实验中，提前4天给予工程菌可显著提高感染后的小鼠存活率。在42天观察期内，工程菌持续产生噬菌体，连续3次阻止侵袭能力受损的沙门菌突变株建立肠道定植。该研究通过将前噬菌体稳定整合与裂解性噬菌体持续生产相结合，为肠道细菌感染的长期预防提供了新策略。

doi:10.1038/s41564-026-02484-3

No.3 Nat Microbiol

Petra Anne Levin 团队

从群体到单细胞：细菌如何调控生长速率

近日，来自美国圣路易斯华盛顿大学和威斯康星大学麦迪逊分校的团队发表观点文章，探讨细菌生长速率如何受到调控，以及同一群体中的细菌为何生长快慢不一。传统研究主要通过群体平均值描述细菌生长，但单细胞研究发现，即使群体处于稳定生长状态，个体生长速率仍可低至群体平均值的一半，或高达其两倍。作者指出，营养供给与细胞内生物合成需求之间的平衡，是理解细菌生长调控的关键。信号分子(p)ppGpp参与协调这一过程：营养匮乏时，其大量积累可抑制核糖体合成等活动，使细菌减缓生长；在正常生长条件下，则参与调节细胞的资源分配。基于此，作者提出，单个细胞内营养供需及生物合成活动的随机波动，可能引起(p)ppGpp水平变化，并通过反馈调节生长速率，从而形成群体内部的个体差异。文章还讨论了生长速率、细胞大小与细胞周期之间的联系，指出三者可能共同受到细胞内生物合成活动的影响，而非简单的单向因果关系。这一单细胞反馈模型仍有待直接验证，但为解释细菌生长异质性、改进单细胞生长调控研究提供了新的思路。

doi:10.1038/s41564-026-02449-6

No.4 PNAS

Carey D. Nadell 团队

生物膜空间结构限制温和噬菌体传播

近日，来自达特茅斯学院和印第安纳大学的团队研究了生物膜中温和噬菌体如何影响细菌竞争与共存。研究人员在甲壳素表面培养霍乱弧菌生物膜，模拟其天然海洋生境。结果发现，当携带K139前噬菌体的溶原菌较少时，前噬菌体自发诱导释放K139，杀死周围不携带前噬菌体的敏感菌，使溶原菌获得竞争优势。随着溶原菌增多，生物膜的空间限制及溶原菌的超感染免疫共同阻碍K139接触剩余敏感菌；当溶原菌占比达到约85%–90%时，敏感菌感染率急剧下降。此时，溶原菌仍需承担前噬菌体自发诱导造成的死亡成本，因此无法完全取代敏感菌，最终形成两类细菌共存。研究揭示了温和噬菌体在生物膜中的自我传播限制机制，为理解天然环境中的噬菌体—细菌共存及噬菌体在生物膜中的传播规律提供了依据。

doi:10.1073/pnas.2531341123

No.5 The ISME Journal

Subham Mridha 等

大肠杆菌通过改变外膜逃避捕食性细菌

近日，来自苏黎世大学等机构的Subham Mridha、Simona G. Huwiler团队发现，大肠杆菌可通过改变外膜结构，进化出对捕食性细菌蛭弧菌(Bdellovibrio bacteriovorus)的耐受。研究人员让大肠杆菌K-12经历15轮不同强度的捕食压力，发现耐受表型早在第2轮即可出现，且捕食压力越高，耐受程度越强。进一步结合基因组、蛋白质组及基因敲除实验发现，外膜孔蛋白OmpF是主要进化靶点：多个独立菌系通过不同突变降低OmpF表达，而敲除ompF可使大肠杆菌获得完全的捕食耐受；LPS合成相关基因waaF突变也可产生部分耐受。值得注意的是，这种耐受伴随明显的生长代价，耐受程度越高，无捕食压力下的生长能力越弱。研究揭示了细菌逃避蛭弧菌捕食的进化路径，同时提示这一适应代价未来或可被利用，以提高“活抗生素（living antibiotics）”策略的可持续性。

doi:10.1093/ismejo/wrag235

No.6 Nucleic Acids Res.

Jorge Moura de Sousa 等

温和噬菌体及其卫星推动细菌防御系统快速更新

近日，法国巴斯德研究所研究团队发现，温和噬菌体及噬菌体卫星(phage satellite，一类依赖辅助噬菌体传播的移动遗传元件)是细菌抗噬菌体防御系统的重要载体。研究分析3085个P4样卫星和1511个P2样温和噬菌体，发现57%的P4和49%的P2携带完整防御系统，计入候选系统后比例分别升至73%和81%。这些防御基因集中在少数基因组“热点”，能够快速替换和重组：即使核心基因高度相似的P2样噬菌体或P4样噬菌体卫星，也可能携带完全不同的防御系统，表明其防御能力的更新远快于自身核心基因的演化。频繁重组还可将不同防御系统的组分重新组合，产生具有功能的新型“嵌合”系统。研究表明，温和噬菌体和噬菌体卫星不仅携带抗病毒基因，还通过防御模块的快速更替与重组，持续重塑宿主细菌的抗噬菌体“武器库”。

doi:10.1093/nar/gkag898

No.7 Nucleic Acids Res.

陈丽霞/周彪/李华/吴云昆

噬菌体通过NAD+重建反制细菌抗病毒防御

近日，福建中医药大学、广州医科大学及沈阳药科大学研究团队解析了噬菌体应对细菌NAD+耗竭型免疫的关键分子机制。部分细菌在遭遇噬菌体后会主动消耗细胞内NAD+，切断噬菌体复制所需的代谢资源；作为反制，噬菌体可利用NAD+重建通路NARP1，将这些降解产物重新“回收”合成NAD+。研究通过X射线晶体学、冷冻电镜及生化实验，解析了其中关键酶Adps的3种功能状态，揭示其如何利用ATP，将ADP-核糖(ADPR)转化为ADPR-PP，为后续NAD+再生提供底物。结构分析显示，Adps由经典PRPS样酶“改造”而来：保留原有底物识别框架，却重新设计了ATP结合方式，使其获得新的焦磷酸转移能力；其中Lys185是关键催化位点，突变后ADPR-PP生成完全消失，并削弱NARP1对NAD+耗竭的抵抗能力。研究从结构层面补全了NARP1“回收NAD+”的关键一步，揭示了噬菌体如何改造已有代谢酶，对抗宿主以NAD+耗竭为核心的抗噬菌体防御。

doi:10.1093/nar/gkag901

No.8 PLoS Biol.

Malcolm F. White 团队

环状三腺苷酸调控细菌抗噬菌体防御系统

近日，英国圣安德鲁斯大学研究团队揭示了Ⅱ型Panoptes抗噬菌体系统的作用机制。细菌可利用信号分子启动抗噬菌体防御，而部分噬菌体能通过降解这些分子逃避免疫。研究发现，Ⅱ型Panoptes持续产生环状三腺苷酸(cA3)，使防御蛋白CARF-TM保持失活；当噬菌体降解cA3时，该蛋白被激活，导致细菌外膜通透性增加、生长停滞，从而限制噬菌体增殖。感染实验进一步证实，携带cA3降解酶Acb1的噬菌体受到Panoptes抑制，而失去该酶功能的突变体能够逃避防御。研究揭示了Ⅱ型Panoptes通过感知免疫信号的减少来启动防御的机制，拓展了对细菌抗噬菌体免疫系统的认识。